Yayasan Perguruan Al-Hikmah mempunyai lambang yang terdiri dari :

1. Bintang : Melambangkan sila pertama dari Pancasila yaitu Ketuhanan Yang Maha Esa;

2. Al-Quran : Melambangkan kitab suci umat islam yang berarti bahwa dasar pelajaran Yayasan Perguruan Al-Hikmah adalah berdasarkan Al-Quran dan Hadits Nabi;

3. Tasbiqh : Melambangkan alat pembantu dalam melaksanakan wirid/zikir, yang berarti bahwa dalam mengamalkan ilmu yang telah didapatkan secara istoqomah dan khusyuk;

4. Lingkaran : Yang didalamnya terdapat bintang, tasbiqh dan Al-Quran dan Teks Yayasan Perguruan Al-Hikmah, melambangkan satu kesatuan, yang berarti dalam mengikuti pelajaran harus ada satu usaha harmonis yang merupakan satu kesatuan tindakan.